Dat kunnen APFS snapshots zijn. Die worden vanzelf verwijderd als macOS de ruimte nodig heeft. Ze worden niet meegenomen in een CCC kloon dus dat klopt met wat je ervaart. Zie hier om erachter te komen of de ruimte inderdaad door snapshots wordt ingenomen:

https://support.apple.com/nl-nl/guide/disk-utility/dskuf82354dc/mac

En meestal zijn deze Snapshots even weg na een TimeMachine backup. Maar na de backup beginnen de Snapshots weer overnieuw.

Externe SSD zelf samenstellen: