Volgens je Etrecheck:

Disk Information: (What does this mean?)
OWC Mercury Accelsior PCIe SSD disk0 : (479,95 GB) (Rotational)
EFI (disk0s1) : 210 MB
Mercury (disk0s2) / : 479.09 GB (41.99 GB free)
Recovery HD (disk0s3) [Recovery]: 650 MB

HL-DT-ST DVD-RW GH41N ()

Hitachi HDS5C3030ALA630 disk3 : (3 TB) (Rotational)
EFI (disk3s1) : 210 MB
disk3s2 (disk3s2) : 2 MB
disk3s3 (disk3s3) : 7 MB
disk3s4 (disk3s4) : 3.00 TB
Boot OSX (disk3s5) : 134 MB

Hitachi HDS5C3030ALA630 disk4 : (3 TB) (Rotational)
EFI (disk4s1) : 210 MB
disk4s2 (disk4s2) : 2 MB
disk4s3 (disk4s3) : 7 MB
disk4s4 (disk4s4) : 3.00 TB
Boot OSX (disk4s5) : 134 MB

Hitachi HDS723030ALA640 disk2 : (3 TB) (Rotational)
EFI (disk2s1) : 210 MB
disk2s2 (disk2s2) : 2 MB
disk2s3 (disk2s3) : 7 MB
disk2s4 (disk2s4) : 3.00 TB
Boot OSX (disk2s5) : 134 MB

WDC WD30EFRX-68EUZN0 disk1 : (3 TB) (Rotational)
EFI (disk1s1) : 210 MB
disk1s2 (disk1s2) : 2 MB
disk1s3 (disk1s3) : 7 MB
disk1s4 (disk1s4) : 3.00 TB
disk1s5 (disk1s5) : 134 MB

Crucial_CT1024M550SSD1 disk6 : (1,02 TB) (Solid State - TRIM: No)
EFI (disk6s1) : 210 MB
Macintosh SSD (disk6s2) /Volumes/Macintosh SSD : 1.02 TB (358.87 GB free)

Bedoel je de EFI-partities op de 4 HD's? Die worden bij het aanmaken van de RAID door SoftRAID gemaakt om de RAID bootable te maken. Daar is niks mis mee, ze zijn niet 'aangesloten'; als het goed is worden ze alleen uitgelezen als een volume op de RAID is gekozen als opstartvolume. Ze zijn ook nodig om, als er van een RAID-volume is opgestart, eventueel firmware-updates te kunnen uitvoeren. Niks mis mee.
Ik gebruik SoftRAID omdat Apple vanaf El Capitan de RAID-optie heeft laten vallen.

Overigens: nadat ik peterdh's suggestie om de Mercury opnieuw aan te wijzen als opstartschijf heb opgevolgd heb ik geen stopteken meer gezien.

Mooi zo!

En sorry, ik had me niet gerealiseerd dat je een Software RAID had natuurlijk.