Dat ligt eraan.
Voor gratis software maakt het niet uit.
Voor software die via de App Store niet gratis is, en via een download op de site van de maker wel (bv MedioaInfo) maakt het wel uit.
Voor software die niet gratis is, is de Mac App Store zelden goedkoper dan rechtstreeks kopen, tenzij je bv iTunes tegoed met korting hebt gekocht.