Het kan ook een corrupt voorkeurenbestand zijn. Daar kom je snel achter door InDesign op te starten met de toetsencombie Shift+Option+Command+Control ingedrukt. Je kunt dan de voorkeuren wissen.
Als het probleem nu niet meer optreedt, heeft het aan de voorkeuren gelegen ; )
Alternatief: maak een nieuwe gebruiker aan en test in die omgeving of het nog steeds gebeurt.