@willemijngreven en @karel apple, nog bedankt voor jullie antwoorden en tips.
De Aperture bibliotheek checken zoals @willemijngreven suggereerde heeft niet tot het gewenste resultaat geleid. Die is (zijn, want heb er drie) in orde. Ondertussen ben ik wel wat opgeschoten. Omdat het beschreven probleem verder werken in Aperture onmogelijk maakt, heb ik ervoor gekozen om de laatste systeem-back-up terug te zetten. Back-ups van de Aperture database maak ik regelmatig apart op een Drobo. Daarnaast maak ik kopieën van het hele OSX-systeem via Time Machine maar ook regelmatig een kloon van het hele systeem via Carbon Copy Cloner. De laatste heeft het voordeel dat je snel verder kunt werken door eenvoudig de externe HD in te prikken en daarop te herstarten.
Aldus heb ik mijn systeem hersteld en ging daarmee terug terug naar Aperture 3.1.1, maar ook naar OSX 10.6.6 en voorbij diverse kleinere updates als Java, Safari, etc.. Hiermee werkte alles weer als vanouds en zoals het hoort.
Vervolgens heb ik om de fout nader te identificeren één voor één telkens één update gedraaid, deze getest en bij goedvinden weer in CCC een systeemback-up gemaakt. Zo doorliep ik alle updates, inclusief Aperture 3.1.2 tot als laatste de systeemupdate van OSX 10.6.7. En bij deze laatste gaat het inderdaad weer mis en treedt de beschreven fout weer op van de volkomen verkeerde previews van PSD-bestanden in Aperture en PSD-bestanden opgeslagen in Aperture naar Photoshop, die tegengesteld aan elkaar een volkomen verkeerde kleurverzadiging en brightnis geven.
Wat er exact fout gaat weet ik niet, alleen dat het misgaat met de OSX-update naar 10.6.7.. Het zal duidelijk zijn dat ik deze OSX-update dan maar aan me voorbij laat gaan! Alles werkt nu zoals het hoort, gelukkig maar, want ik kan Aperture absoluut niet missen. Misschien dat later nog eens de kern van het probleem opduikt: ik kan nu weer verder.
Nogmaals bedankt voor jullie reactie!