De "profiles"-map bevat naast de mails ook alle instellingen. De hele map verwijderen zou ik dan ook alleen doen als je Thunderbird helemaal niet meer wil gebruiken.
Ik heb al lang geen Thunderbird meer gebruikt, maar kun je bij de instellingen niet aangeven dat hij niet alles moet downloaden voor offline gebruik?
Of alleen de headers+mails, maar niet de bijlagen?
(ik herinner me dat ik die instelling juist altijd op alles wél downloaden zette zodat ik alles ook offline beschikbaar had, maar ieder zijn voorkeur).
Check ook even of je je mailboxen op automatisch "compacten" (comprimeren?) hebt staan. Mogelijk is daar ook al wat winst mee te halen als dat niet op automatisch staat.