Er is inmiddels een El Capitan bug fix release geweest. Zie
http://www.macfreak.nl/nieuws/27315/update-os-x-10111-met-fix-voor-office-2016-en-meer en je zou het nog een keer kunnen proberen. Wel weer een backup klaarzetten voor als het weer mis gaat.
Vaak worden problemen met een os x upgrade veroorzaakt door oude (meestal niet-Apple) applicaties/drivers/add-ons die niet meer compatibel zijn met een nieuwe OS X versie.
Daar is sinds de vrijgave van El Capitan niets aan veranderd: als het toen niet werkte
zal het nu ook niet werken. El Capitan is weer strenger geworden in een poging de beveiliging te versterken. Bij twijfel zou je een Etrecheck rapport kunnen maken en kijken of je daar spoken ziet.
Een erg volle HDD blokkeert de installatie ook.
Waarom moet je naar El Capitan? Een schone installatie (dat wil zeggen: systeemschijf wissen,
El Capitan installeren, overige apps en data -voorzover noodzakelijk- terughalen van backup)
zal wel lukken, tenzij er hardware problemen zijn. Bij twijfel de bekende diagnostische hulpmiddelen (hardware test, schijf EHBO) eerst proberen.