Die vraag krijg ik ook regelmatig. Ook bij Firefox en nog wat andere apps die met het netwerk verbinding kunnen/willen hebben.
Het lijkt er op de dat interne firewall van Snow Leopard te traag reageert op zijn eigen regels, of in verkeerde volgorde.
Eerst wordt de melding getoond, dan de regels gecontroleerd of het al een keer toegestaan is, en vervolgens ziet de firewall dat er eerder toestemming is gegeven en sluit de pop-up weer.
Zou natuurlijk andersom moeten, eerst checken en als er GEEN toestemming in de regels staat, een pop-up laten zien.