Ik vermoed dat het eerder aan Lion ligt dan aan QT.
Ik zie bij het draaien van Python programma's in Lion ook extra Terminal vensters opkomen. Ik heb me er tot nu toe nog niet zo druk over gemaakt. Als ik een oplossing vind zal ik het je laten weten.
Overigens: met QT heb ik in het verleden ook gewerkt. Als je QT vooral gekozen hebt om platformonafhankelijke programma's te schrijven moet je zeker ook eens naar Python kijken. Met wxPython heb je zo een GUI in elkaar gestekkerd die er nog Mac-like uitziet op de Mac ook. Maar ik dwaal af...