Omdat je importeert vanuit iPhoto vermoed ik dat je het niet hebt over materiaal uit een videocamera, maar eerder iets uit een fotocamera of zo. Het is moeilijk om advies te geven als je niet aangeeft wat voor bestanden het zijn.
Heb je het al geprobeerd in iMovie?
Programma's waarmee je allerlei bestandsconversies kunt doen zijn o.a. QuickTime Pro en MPEG Streamclip. De eerste krijg je mee met Final Cut (pro) en de tweede is gratis.