Nee nee, zo werkt QuickTime niet. De media-sporen van QuickTime
zijn niet zomaar te vergelijken met de viedo- of audiosporen in een
video-programma, die je dan later tot één spoor laat samensmelten.
Er zijn hooguit enkele codecs (zoals MPEG1) die alle audio en video
tegelijk coderen in een MPEG-spoor, maar dat is ook niet hetzelfde.
Ik herhaal: je zult de ondertitel-track in brokken moeten knippen
en m.b.v. QuickTime Pro er weer zelf bij moeten plakken. Misschien
is er andere/handigere software voor dit doel, maar dat weet ik niet.