Metatags zijn voor Google steeds minder belangrijk. Het kan geen kwaad ze over te nemen, maar verwacht er geen wonderen van. Voor sommige andere zoekmachines zijn ze nog wel belangrijk, overigens.
Het gaat om de inhoud. Wat staat er in de titel, wat staat er in de titelbalk van het browservenster, wat staat er in de teksten. Welke termen komen in het menu voor.
En om dat goed te kunnen vinden, moet je zorgen dat je site aan de w3c-richtlijnen voldoet (de webstandaards). Dan kan Google er ook mee overweg.
Oude site laten staan zou ik niet doen, dan vinden mensen nog steeds die pagina's via Google, en dan komen ze dus op de oude site. Zorg je er met een redirect-truc voor dat mensen dan toch op de nieuwe pagina's komen, dan helpt het voor de vindbaarheid ook niet.
Nieuwe site zou ik zeker in de root zetten. Gewoon de oude site backuppen, en desnoods een tijdelijk index-bestand neerzetten (even aan het werk) terwijl je de nieuwe site plaatst.