edit-je:
De link waar je zelf mee komt is leuk voor als je WordPress alleen als een Blog wilt gebruiken. Dus stel jij hebt een website en dan wil je 1 pagina aanmaken waar je een Blog pagina op wilt maken. Een pagina waar mensen kunnen reageren op de artikels die jij schrijft.
Dit kan handig zijn maar vaak is het moeilijk om de WordPress pagina dan dezelfde layout (huisstijl) te geven als de rest van de website.
Beter is je huidige website helemaal omzetten naar een WordPress Thema. Dan kun je WordPress als Blog, CMS , Webshop, Forum of wat dan ook gebruiken.
Zoals @Sypie al aangeeft het is meer begrijpend lezen en bestanden volgen..
Als jij je HTML CSS website zelf hebt gemaakt en begrijpt hoe die werkt dan durf ik er bijna 100,- op te zetten dat jij een WordPress thema kan maken. Je moet alleen durven!!
Het lijkt ingewikkelder dan het in werkelijkheid is. Mede door de WP Codex die jij nu al gevonden hebt leer je stap voor stap dingen begrijpen.
Wat WordPress doet is het hakt zeg maar je website in delen.
Dus als jij begrijpt wat een Header, Footer, Sidebar en Content gedeelte is dan weet je dat al deze onderdelen nodig zijn om een web pagina te tonen.

* navigation staat vaak gewoon in de Header.
In WordPress wilt dat zeggen dat je de volgende bestanden nodig hebt.
header.php (header)
footer.php (footer)
sidebar.php (sidebar)
index.php > content.php > content-video.php (content)
Over het algemeen heb je de eerste 3 templates ( .php bestanden) altijd nodig bij het tonen van elke pagina. Maar niet elke pagina heeft dezelfde content vandaar dat er op elke pagina een andere content template wordt aangesproken. Standaard is dat de index.php op de homepage. De index.php toont de 10 laatste blog posts. Maar wil jij bijv. een contact pagina tonen dan wordt ipv index.php page.php gelezen en getoond als Content gedeelte.
Lees deze pagina eens helemaal en bekijk de afb. daar kun je zien welke templates er gelezen worden voor het tonen van een X webpagina.
http://codex.wordpress.org/Template_Hierarchy
(Bewerkt door Shmoo om 19:12, 27-12-2012)